I genotipi sono varianti genetiche dello stesso virus.

Per il virus dell’epatite C sono stati, ad oggi, identificati almeno sei principali genotipi (genotipi 1-6 secondo la classificazione di Simmonds).

Ciascun genotipo contiene diversi sottotipi contrassegnati dalle lettere minuscole dell’alfabeto.

A sua volta ogni sottotipo contiene numerose varianti dovute a mutazioni che si verificano nel virus dello stesso paziente.

Si attribuisce ai diversi genotipi un significato che caratterizza l’infezione e la risposta alla terapia con interferone e Ribavirina.

Infatti, per esempio, il genotipo 1 è più difficile da trattare con interferone e Ribavirina rispetto ai genotipi 2 e 3.

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